Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBRP36941 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBRP36941 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBRP36941 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBRP36941 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBRP36941 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBRP36941 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBRP36941 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBRP36941 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBRP36941 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBRP36941 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBRP36941 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBRP36941 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBRP36941 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBRP36941 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBRP36941 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBRP36941 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBRP36941 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBRP36941 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBRP36941 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBRP36941 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBRP36941 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBRP36941 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LTBRP36941 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBRP36941 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBRP36941 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBRP36941 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBRP36941 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBRP36941 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBRP36941 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBRP36941 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBRP36941 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBRP36941 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBRP36941 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBRP36941 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBRP36941 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBRP36941 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBRP36941 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBRP36941 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBRP36941 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBRP36941 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBRP36941 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBRP36941 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBRP36941 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBRP36941 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBRP36941 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBRP36941 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBRP36941 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBRP36941 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBRP36941 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBRP36941 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBRP36941 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBRP36941 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBRP36941 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBRP36941 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBRP36941 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBRP36941 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBRP36941 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBRP36941 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBRP36941 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBRP36941 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBRP36941 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBRP36941 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBRP36941 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBRP36941 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBRP36941 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBRP36941 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBRP36941 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBRP36941 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBRP36941 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBRP36941 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBRP36941 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBRP36941 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBRP36941 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBRP36941 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBRP36941 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBRP36941 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBRP36941 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBRP36941 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBRP36941 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBRP36941 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBRP36941 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBRP36941 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBRP36941 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBRP36941 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBRP36941 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBRP36941 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBRP36941 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBRP36941 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBRP36941 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBRP36941 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBRP36941 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBRP36941 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBRP36941 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBRP36941 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBRP36941 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBRP36941 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBRP36941 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBRP36941 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBRP36941 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms