Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM23P36406 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms