Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPB2P35606 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPB2P35606 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPB2P35606 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPB2P35606 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPB2P35606 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPB2P35606 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPB2P35606 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPB2P35606 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPB2P35606 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPB2P35606 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPB2P35606 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPB2P35606 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPB2P35606 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COPB2P35606 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPB2P35606 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPB2P35606 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPB2P35606 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPB2P35606 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPB2P35606 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPB2P35606 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPB2P35606 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPB2P35606 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPB2P35606 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPB2P35606 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPB2P35606 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPB2P35606 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPB2P35606 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPB2P35606 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPB2P35606 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPB2P35606 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPB2P35606 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPB2P35606 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPB2P35606 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPB2P35606 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPB2P35606 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPB2P35606 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPB2P35606 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPB2P35606 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPB2P35606 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPB2P35606 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPB2P35606 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPB2P35606 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPB2P35606 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPB2P35606 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPB2P35606 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPB2P35606 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPB2P35606 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPB2P35606 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPB2P35606 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPB2P35606 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPB2P35606 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPB2P35606 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPB2P35606 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB2P35606 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB2P35606 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB2P35606 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB2P35606 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB2P35606 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB2P35606 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB2P35606 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB2P35606 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB2P35606 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB2P35606 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB2P35606 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB2P35606 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB2P35606 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB2P35606 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB2P35606 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB2P35606 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPB2P35606 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB2P35606 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB2P35606 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB2P35606 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB2P35606 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB2P35606 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB2P35606 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB2P35606 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB2P35606 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB2P35606 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB2P35606 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB2P35606 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB2P35606 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB2P35606 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB2P35606 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB2P35606 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPB2P35606 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPB2P35606 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPB2P35606 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPB2P35606 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPB2P35606 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPB2P35606 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPB2P35606 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPB2P35606 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPB2P35606 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPB2P35606 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPB2P35606 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB2P35606 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB2P35606 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPB2P35606 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms