Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RCVRNP35243 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RCVRNP35243 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RCVRNP35243 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RCVRNP35243 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RCVRNP35243 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RCVRNP35243 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCVRNP35243 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCVRNP35243 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCVRNP35243 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCVRNP35243 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCVRNP35243 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCVRNP35243 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCVRNP35243 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCVRNP35243 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCVRNP35243 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCVRNP35243 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RCVRNP35243 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms