Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA1P35221 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms