Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL9P32969 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL9P32969 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL9P32969 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL9P32969 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL9P32969 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL9P32969 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL9P32969 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL9P32969 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL9P32969 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL9P32969 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL9P32969 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL9P32969 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL9P32969 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL9P32969 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL9P32969 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL9P32969 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL9P32969 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL9P32969 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL9P32969 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL9P32969 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL9P32969 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL9P32969 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL9P32969 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL9P32969 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL9P32969 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL9P32969 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL9P32969 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL9P32969 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL9P32969 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL9P32969 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL9P32969 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL9P32969 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL9P32969 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL9P32969 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL9P32969 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL9P32969 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL9P32969 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL9P32969 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL9P32969 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL9P32969 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL9P32969 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL9P32969 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL9P32969 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL9P32969 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL9P32969 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL9P32969 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL9P32969 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL9P32969 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL9P32969 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL9P32969 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL9P32969 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL9P32969 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL9P32969 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL9P32969 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL9P32969 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL9P32969 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL9P32969 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL9P32969 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL9P32969 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL9P32969 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL9P32969 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL9P32969 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL9P32969 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL9P32969 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL9P32969 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL9P32969 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL9P32969 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL9P32969 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL9P32969 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL9P32969 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL9P32969 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL9P32969 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL9P32969 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL9P32969 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL9P32969 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL9P32969 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL9P32969 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL9P32969 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL9P32969 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL9P32969 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL9P32969 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL9P32969 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL9P32969 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL9P32969 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL9P32969 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL9P32969 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL9P32969 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL9P32969 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL9P32969 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL9P32969 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL9P32969 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL9P32969 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL9P32969 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL9P32969 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL9P32969 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL9P32969 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL9P32969 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL9P32969 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL9P32969 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms