Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CPS1P31327 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CPS1P31327 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CPS1P31327 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CPS1P31327 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CPS1P31327 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CPS1P31327 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CPS1P31327 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CPS1P31327 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CPS1P31327 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CPS1P31327 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CPS1P31327 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPS1P31327 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPS1P31327 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPS1P31327 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPS1P31327 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPS1P31327 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPS1P31327 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPS1P31327 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPS1P31327 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPS1P31327 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPS1P31327 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPS1P31327 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPS1P31327 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPS1P31327 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPS1P31327 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPS1P31327 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPS1P31327 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPS1P31327 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPS1P31327 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPS1P31327 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CPS1P31327 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CPS1P31327 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CPS1P31327 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CPS1P31327 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CPS1P31327 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CPS1P31327 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CPS1P31327 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CPS1P31327 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CPS1P31327 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPS1P31327 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPS1P31327 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPS1P31327 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CPS1P31327 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPS1P31327 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPS1P31327 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPS1P31327 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPS1P31327 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPS1P31327 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPS1P31327 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CPS1P31327 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CPS1P31327 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CPS1P31327 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPS1P31327 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPS1P31327 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CPS1P31327 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CPS1P31327 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPS1P31327 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPS1P31327 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPS1P31327 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CPS1P31327 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CPS1P31327 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CPS1P31327 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CPS1P31327 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CPS1P31327 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CPS1P31327 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CPS1P31327 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CPS1P31327 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CPS1P31327 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CPS1P31327 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CPS1P31327 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPS1P31327 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPS1P31327 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPS1P31327 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPS1P31327 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPS1P31327 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPS1P31327 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPS1P31327 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPS1P31327 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CPS1P31327 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPS1P31327 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPS1P31327 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPS1P31327 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CPS1P31327 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CPS1P31327 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CPS1P31327 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CPS1P31327 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CPS1P31327 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CPS1P31327 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CPS1P31327 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CPS1P31327 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CPS1P31327 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CPS1P31327 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPS1P31327 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPS1P31327 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CPS1P31327 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPS1P31327 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CPS1P31327 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPS1P31327 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPS1P31327 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms