Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC8P31273 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms