Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB2P29033 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB2P29033 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GJB2P29033 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GJB2P29033 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GJB2P29033 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB2P29033 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB2P29033 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB2P29033 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB2P29033 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB2P29033 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB2P29033 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB2P29033 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB2P29033 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB2P29033 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB2P29033 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB2P29033 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB2P29033 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB2P29033 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB2P29033 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB2P29033 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB2P29033 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB2P29033 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB2P29033 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB2P29033 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB2P29033 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB2P29033 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB2P29033 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB2P29033 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB2P29033 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB2P29033 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB2P29033 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB2P29033 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB2P29033 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB2P29033 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB2P29033 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB2P29033 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB2P29033 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB2P29033 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB2P29033 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB2P29033 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB2P29033 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB2P29033 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB2P29033 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB2P29033 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB2P29033 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB2P29033 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB2P29033 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB2P29033 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB2P29033 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB2P29033 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB2P29033 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB2P29033 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB2P29033 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB2P29033 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB2P29033 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB2P29033 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB2P29033 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB2P29033 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB2P29033 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB2P29033 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB2P29033 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB2P29033 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB2P29033 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB2P29033 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB2P29033 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB2P29033 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB2P29033 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB2P29033 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB2P29033 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB2P29033 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB2P29033 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB2P29033 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB2P29033 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB2P29033 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB2P29033 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB2P29033 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB2P29033 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB2P29033 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB2P29033 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB2P29033 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB2P29033 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB2P29033 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB2P29033 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB2P29033 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB2P29033 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB2P29033 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB2P29033 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB2P29033 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB2P29033 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB2P29033 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB2P29033 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB2P29033 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB2P29033 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB2P29033 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB2P29033 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB2P29033 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB2P29033 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB2P29033 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB2P29033 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms