Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRMP28827 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRMP28827 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRMP28827 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
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