Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMGB2P26583 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms