Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms