Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR1P24390 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR1P24390 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR1P24390 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR1P24390 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR1P24390 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR1P24390 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR1P24390 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR1P24390 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR1P24390 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR1P24390 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR1P24390 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR1P24390 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR1P24390 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR1P24390 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR1P24390 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR1P24390 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR1P24390 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR1P24390 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR1P24390 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR1P24390 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR1P24390 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDELR1P24390 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDELR1P24390 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDELR1P24390 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDELR1P24390 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDELR1P24390 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDELR1P24390 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDELR1P24390 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KDELR1P24390 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDELR1P24390 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KDELR1P24390 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDELR1P24390 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDELR1P24390 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDELR1P24390 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDELR1P24390 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDELR1P24390 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KDELR1P24390 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDELR1P24390 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDELR1P24390 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms