Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4BP23588 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms