Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.81
PTPRGP23470 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
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