Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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