Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2B1P20020 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms