Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM21P19474 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms