Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF3P18847 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF3P18847 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF3P18847 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF3P18847 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF3P18847 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF3P18847 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF3P18847 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF3P18847 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF3P18847 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF3P18847 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF3P18847 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF3P18847 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF3P18847 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF3P18847 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF3P18847 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ATF3P18847 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF3P18847 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF3P18847 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF3P18847 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF3P18847 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF3P18847 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF3P18847 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF3P18847 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF3P18847 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF3P18847 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF3P18847 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF3P18847 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF3P18847 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF3P18847 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF3P18847 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF3P18847 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF3P18847 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF3P18847 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF3P18847 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF3P18847 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF3P18847 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF3P18847 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF3P18847 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF3P18847 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF3P18847 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF3P18847 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF3P18847 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF3P18847 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF3P18847 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF3P18847 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF3P18847 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF3P18847 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF3P18847 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF3P18847 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF3P18847 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF3P18847 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF3P18847 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF3P18847 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF3P18847 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF3P18847 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF3P18847 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF3P18847 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF3P18847 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF3P18847 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF3P18847 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF3P18847 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF3P18847 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF3P18847 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF3P18847 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF3P18847 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF3P18847 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF3P18847 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF3P18847 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF3P18847 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF3P18847 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF3P18847 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF3P18847 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF3P18847 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF3P18847 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF3P18847 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF3P18847 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF3P18847 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF3P18847 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF3P18847 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF3P18847 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF3P18847 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF3P18847 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF3P18847 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF3P18847 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF3P18847 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF3P18847 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF3P18847 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF3P18847 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF3P18847 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF3P18847 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF3P18847 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF3P18847 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF3P18847 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATF3P18847 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATF3P18847 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATF3P18847 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATF3P18847 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATF3P18847 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ATF3P18847 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms