Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF7P17544 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF7P17544 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF7P17544 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF7P17544 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF7P17544 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF7P17544 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF7P17544 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF7P17544 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF7P17544 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF7P17544 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF7P17544 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF7P17544 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF7P17544 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF7P17544 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF7P17544 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF7P17544 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF7P17544 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF7P17544 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF7P17544 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF7P17544 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF7P17544 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF7P17544 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF7P17544 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF7P17544 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF7P17544 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF7P17544 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF7P17544 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF7P17544 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF7P17544 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF7P17544 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF7P17544 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF7P17544 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF7P17544 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF7P17544 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF7P17544 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF7P17544 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF7P17544 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF7P17544 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF7P17544 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF7P17544 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF7P17544 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF7P17544 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF7P17544 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF7P17544 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF7P17544 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF7P17544 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF7P17544 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF7P17544 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF7P17544 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF7P17544 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF7P17544 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF7P17544 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF7P17544 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF7P17544 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF7P17544 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF7P17544 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF7P17544 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF7P17544 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF7P17544 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF7P17544 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF7P17544 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF7P17544 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF7P17544 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF7P17544 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF7P17544 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF7P17544 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF7P17544 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF7P17544 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF7P17544 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF7P17544 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF7P17544 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF7P17544 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF7P17544 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF7P17544 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF7P17544 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF7P17544 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF7P17544 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATF7P17544 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF7P17544 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF7P17544 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF7P17544 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF7P17544 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF7P17544 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF7P17544 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF7P17544 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF7P17544 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF7P17544 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF7P17544 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF7P17544 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF7P17544 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF7P17544 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF7P17544 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF7P17544 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF7P17544 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF7P17544 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF7P17544 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF7P17544 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF7P17544 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF7P17544 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms