Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms