Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT10P13645 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT10P13645 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT10P13645 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT10P13645 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT10P13645 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT10P13645 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT10P13645 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT10P13645 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT10P13645 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT10P13645 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT10P13645 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT10P13645 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT10P13645 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT10P13645 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT10P13645 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT10P13645 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT10P13645 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT10P13645 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT10P13645 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT10P13645 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT10P13645 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT10P13645 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT10P13645 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT10P13645 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT10P13645 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT10P13645 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT10P13645 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT10P13645 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT10P13645 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT10P13645 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT10P13645 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT10P13645 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT10P13645 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT10P13645 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT10P13645 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT10P13645 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT10P13645 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT10P13645 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT10P13645 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT10P13645 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT10P13645 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT10P13645 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT10P13645 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT10P13645 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT10P13645 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT10P13645 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT10P13645 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT10P13645 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT10P13645 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT10P13645 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT10P13645 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT10P13645 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT10P13645 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT10P13645 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT10P13645 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT10P13645 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT10P13645 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT10P13645 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT10P13645 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT10P13645 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT10P13645 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT10P13645 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT10P13645 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT10P13645 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT10P13645 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT10P13645 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT10P13645 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT10P13645 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT10P13645 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT10P13645 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT10P13645 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT10P13645 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT10P13645 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT10P13645 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT10P13645 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT10P13645 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT10P13645 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT10P13645 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT10P13645 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT10P13645 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT10P13645 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT10P13645 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT10P13645 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT10P13645 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT10P13645 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT10P13645 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT10P13645 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT10P13645 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT10P13645 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT10P13645 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT10P13645 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT10P13645 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT10P13645 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT10P13645 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT10P13645 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT10P13645 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT10P13645 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT10P13645 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT10P13645 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms