Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH1P12830 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH1P12830 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH1P12830 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH1P12830 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH1P12830 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH1P12830 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH1P12830 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH1P12830 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH1P12830 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH1P12830 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH1P12830 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH1P12830 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH1P12830 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH1P12830 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH1P12830 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH1P12830 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH1P12830 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH1P12830 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH1P12830 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH1P12830 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH1P12830 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH1P12830 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH1P12830 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH1P12830 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH1P12830 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH1P12830 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH1P12830 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH1P12830 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDH1P12830 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH1P12830 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH1P12830 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH1P12830 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH1P12830 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH1P12830 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH1P12830 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH1P12830 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH1P12830 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH1P12830 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH1P12830 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH1P12830 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH1P12830 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH1P12830 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH1P12830 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH1P12830 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH1P12830 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH1P12830 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH1P12830 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH1P12830 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH1P12830 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDH1P12830 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDH1P12830 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH1P12830 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH1P12830 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH1P12830 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH1P12830 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH1P12830 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH1P12830 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH1P12830 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH1P12830 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH1P12830 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH1P12830 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH1P12830 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH1P12830 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH1P12830 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH1P12830 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH1P12830 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH1P12830 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH1P12830 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH1P12830 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH1P12830 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH1P12830 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH1P12830 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH1P12830 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH1P12830 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms