Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms