Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGA3P0DJD8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms