Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC2BP0DI82 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms