Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN3P07498 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN3P07498 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN3P07498 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN3P07498 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSN3P07498 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSN3P07498 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSN3P07498 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN3P07498 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN3P07498 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN3P07498 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN3P07498 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN3P07498 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN3P07498 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN3P07498 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN3P07498 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN3P07498 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSN3P07498 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms