Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAVP06756 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAVP06756 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAVP06756 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAVP06756 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAVP06756 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAVP06756 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAVP06756 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAVP06756 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAVP06756 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAVP06756 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAVP06756 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAVP06756 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAVP06756 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGAVP06756 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAVP06756 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAVP06756 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAVP06756 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAVP06756 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAVP06756 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAVP06756 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAVP06756 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAVP06756 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAVP06756 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGAVP06756 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAVP06756 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAVP06756 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAVP06756 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAVP06756 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAVP06756 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAVP06756 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAVP06756 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAVP06756 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAVP06756 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAVP06756 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAVP06756 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAVP06756 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAVP06756 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAVP06756 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAVP06756 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAVP06756 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAVP06756 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGAVP06756 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGAVP06756 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAVP06756 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAVP06756 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAVP06756 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAVP06756 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAVP06756 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAVP06756 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAVP06756 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAVP06756 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAVP06756 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAVP06756 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAVP06756 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAVP06756 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAVP06756 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAVP06756 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAVP06756 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAVP06756 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAVP06756 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAVP06756 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms