Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAP2AP05549 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAP2AP05549 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAP2AP05549 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAP2AP05549 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAP2AP05549 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAP2AP05549 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAP2AP05549 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAP2AP05549 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAP2AP05549 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAP2AP05549 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAP2AP05549 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAP2AP05549 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAP2AP05549 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAP2AP05549 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAP2AP05549 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAP2AP05549 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAP2AP05549 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAP2AP05549 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAP2AP05549 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAP2AP05549 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAP2AP05549 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAP2AP05549 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms