Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTNP04004 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VTNP04004 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTNP04004 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VTNP04004 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VTNP04004 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTNP04004 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VTNP04004 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTNP04004 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTNP04004 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTNP04004 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTNP04004 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTNP04004 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTNP04004 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTNP04004 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTNP04004 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTNP04004 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTNP04004 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTNP04004 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTNP04004 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VTNP04004 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTNP04004 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTNP04004 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTNP04004 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTNP04004 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTNP04004 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTNP04004 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTNP04004 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTNP04004 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTNP04004 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTNP04004 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTNP04004 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTNP04004 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTNP04004 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTNP04004 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTNP04004 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTNP04004 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTNP04004 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VTNP04004 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTNP04004 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTNP04004 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTNP04004 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VTNP04004 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTNP04004 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTNP04004 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTNP04004 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTNP04004 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTNP04004 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTNP04004 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTNP04004 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTNP04004 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTNP04004 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTNP04004 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms