Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms