Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCAP01258 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCAP01258 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCAP01258 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCAP01258 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCAP01258 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCAP01258 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALCAP01258 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCAP01258 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCAP01258 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCAP01258 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCAP01258 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCAP01258 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCAP01258 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCAP01258 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCAP01258 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCAP01258 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCAP01258 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCAP01258 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCAP01258 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCAP01258 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCAP01258 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCAP01258 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCAP01258 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCAP01258 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCAP01258 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALCAP01258 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALCAP01258 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALCAP01258 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALCAP01258 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALCAP01258 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCAP01258 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCAP01258 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCAP01258 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCAP01258 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCAP01258 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCAP01258 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCAP01258 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCAP01258 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCAP01258 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCAP01258 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCAP01258 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCAP01258 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCAP01258 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCAP01258 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCAP01258 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCAP01258 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCAP01258 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALCAP01258 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCAP01258 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCAP01258 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCAP01258 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCAP01258 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCAP01258 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCAP01258 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCAP01258 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCAP01258 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCAP01258 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCAP01258 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCAP01258 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCAP01258 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCAP01258 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCAP01258 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCAP01258 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCAP01258 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALCAP01258 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCAP01258 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCAP01258 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCAP01258 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCAP01258 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCAP01258 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCAP01258 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCAP01258 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCAP01258 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCAP01258 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCAP01258 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCAP01258 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCAP01258 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCAP01258 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCAP01258 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCAP01258 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCAP01258 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCAP01258 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCAP01258 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCAP01258 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCAP01258 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCAP01258 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCAP01258 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCAP01258 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCAP01258 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCAP01258 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCAP01258 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCAP01258 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCAP01258 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCAP01258 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCAP01258 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCAP01258 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCAP01258 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCAP01258 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCAP01258 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms