Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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