Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms