Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL3O95236 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL3O95236 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL3O95236 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL3O95236 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL3O95236 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL3O95236 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL3O95236 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL3O95236 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL3O95236 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL3O95236 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL3O95236 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL3O95236 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL3O95236 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL3O95236 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL3O95236 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL3O95236 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL3O95236 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL3O95236 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL3O95236 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL3O95236 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL3O95236 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL3O95236 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL3O95236 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL3O95236 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL3O95236 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL3O95236 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL3O95236 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL3O95236 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL3O95236 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL3O95236 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL3O95236 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL3O95236 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL3O95236 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL3O95236 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL3O95236 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL3O95236 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL3O95236 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL3O95236 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL3O95236 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL3O95236 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL3O95236 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL3O95236 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL3O95236 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOL3O95236 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOL3O95236 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOL3O95236 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOL3O95236 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOL3O95236 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOL3O95236 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOL3O95236 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOL3O95236 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOL3O95236 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOL3O95236 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOL3O95236 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOL3O95236 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOL3O95236 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOL3O95236 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOL3O95236 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOL3O95236 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOL3O95236 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOL3O95236 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOL3O95236 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOL3O95236 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOL3O95236 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOL3O95236 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOL3O95236 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOL3O95236 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOL3O95236 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOL3O95236 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOL3O95236 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOL3O95236 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOL3O95236 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOL3O95236 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms