Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLSTN1O94985 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms