Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG12O94817 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG12O94817 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG12O94817 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG12O94817 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG12O94817 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG12O94817 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG12O94817 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG12O94817 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG12O94817 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG12O94817 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG12O94817 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG12O94817 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG12O94817 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG12O94817 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG12O94817 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG12O94817 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG12O94817 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG12O94817 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG12O94817 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG12O94817 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG12O94817 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms