Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG13O75143 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG13O75143 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG13O75143 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG13O75143 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG13O75143 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG13O75143 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG13O75143 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG13O75143 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG13O75143 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG13O75143 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG13O75143 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG13O75143 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG13O75143 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG13O75143 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG13O75143 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG13O75143 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG13O75143 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG13O75143 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG13O75143 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG13O75143 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG13O75143 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG13O75143 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG13O75143 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG13O75143 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG13O75143 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG13O75143 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG13O75143 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG13O75143 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG13O75143 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG13O75143 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG13O75143 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG13O75143 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG13O75143 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG13O75143 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG13O75143 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG13O75143 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG13O75143 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG13O75143 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG13O75143 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG13O75143 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG13O75143 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG13O75143 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG13O75143 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG13O75143 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG13O75143 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG13O75143 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG13O75143 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG13O75143 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG13O75143 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG13O75143 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG13O75143 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG13O75143 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG13O75143 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG13O75143 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG13O75143 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG13O75143 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG13O75143 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG13O75143 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG13O75143 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG13O75143 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG13O75143 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG13O75143 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG13O75143 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG13O75143 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG13O75143 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG13O75143 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG13O75143 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG13O75143 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG13O75143 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG13O75143 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG13O75143 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG13O75143 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG13O75143 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG13O75143 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG13O75143 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG13O75143 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms