Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GMDSO60547 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GMDSO60547 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GMDSO60547 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GMDSO60547 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GMDSO60547 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GMDSO60547 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GMDSO60547 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GMDSO60547 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GMDSO60547 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GMDSO60547 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GMDSO60547 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GMDSO60547 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GMDSO60547 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GMDSO60547 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GMDSO60547 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GMDSO60547 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMDSO60547 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMDSO60547 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMDSO60547 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMDSO60547 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMDSO60547 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMDSO60547 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GMDSO60547 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMDSO60547 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMDSO60547 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMDSO60547 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMDSO60547 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMDSO60547 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMDSO60547 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMDSO60547 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMDSO60547 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMDSO60547 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMDSO60547 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMDSO60547 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMDSO60547 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMDSO60547 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMDSO60547 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GMDSO60547 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMDSO60547 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMDSO60547 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMDSO60547 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMDSO60547 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMDSO60547 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMDSO60547 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMDSO60547 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMDSO60547 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMDSO60547 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMDSO60547 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMDSO60547 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMDSO60547 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMDSO60547 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMDSO60547 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMDSO60547 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMDSO60547 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMDSO60547 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMDSO60547 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMDSO60547 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMDSO60547 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMDSO60547 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMDSO60547 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMDSO60547 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMDSO60547 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMDSO60547 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMDSO60547 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMDSO60547 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMDSO60547 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMDSO60547 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMDSO60547 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMDSO60547 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMDSO60547 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMDSO60547 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GMDSO60547 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMDSO60547 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMDSO60547 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMDSO60547 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms