Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VEGFDO43915 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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VEGFDO43915 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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VEGFDO43915 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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VEGFDO43915 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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VEGFDO43915 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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VEGFDO43915 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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VEGFDO43915 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VEGFDO43915 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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