Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SYNGR3O43761 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR3O43761 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms