Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KCNQ3O43525 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNQ3O43525 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms