Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUPL2O15504 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms