Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MCF2LO15068 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2LO15068 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms