Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3EO15041 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3EO15041 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms