Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms