Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F3O00716 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F3O00716 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F3O00716 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F3O00716 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F3O00716 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F3O00716 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F3O00716 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F3O00716 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F3O00716 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F3O00716 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F3O00716 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F3O00716 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F3O00716 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F3O00716 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F3O00716 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F3O00716 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F3O00716 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F3O00716 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F3O00716 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F3O00716 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F3O00716 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F3O00716 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F3O00716 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F3O00716 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F3O00716 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F3O00716 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F3O00716 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20■□□□□ 0.79
E2F3O00716 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F3O00716 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F3O00716 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F3O00716 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F3O00716 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F3O00716 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F3O00716 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F3O00716 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F3O00716 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F3O00716 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F3O00716 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F3O00716 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F3O00716 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F3O00716 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F3O00716 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F3O00716 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F3O00716 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F3O00716 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F3O00716 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F3O00716 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F3O00716 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F3O00716 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F3O00716 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F3O00716 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F3O00716 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F3O00716 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F3O00716 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F3O00716 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F3O00716 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F3O00716 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F3O00716 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F3O00716 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F3O00716 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F3O00716 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F3O00716 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F3O00716 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F3O00716 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F3O00716 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F3O00716 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F3O00716 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F3O00716 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F3O00716 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F3O00716 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F3O00716 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F3O00716 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F3O00716 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F3O00716 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F3O00716 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F3O00716 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F3O00716 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F3O00716 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F3O00716 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F3O00716 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F3O00716 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F3O00716 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F3O00716 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F3O00716 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F3O00716 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F3O00716 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F3O00716 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F3O00716 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F3O00716 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F3O00716 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F3O00716 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F3O00716 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F3O00716 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F3O00716 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F3O00716 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F3O00716 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F3O00716 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F3O00716 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F3O00716 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms