Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 TXNDC15-210ENST00000511070 1006 ntTSL 1 (best)16.94■□□□□ 0.33e-11■■■■■ 35
DDX3XO00571 TXNDC15-206ENST00000507024 2893 ntTSL 1 (best)11.64□□□□□ -0.553e-11■■■■■ 35
DDX3XO00571 TXNDC15-201ENST00000358387 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.553e-11■■■■■ 35
DDX3XO00571 AL137782.1-201ENST00000563635 4128 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.969e-8■■■■■ 35
DDX3XO00571 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.45e-54■■■■■ 35
DDX3XO00571 ELP5-211ENST00000573699 864 ntTSL 319.49■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 35
DDX3XO00571 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.362e-21■■■■■ 35
DDX3XO00571 STK24-207ENST00000491878 547 ntTSL 415.48■□□□□ 0.072e-21■■■■■ 35
DDX3XO00571 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.961e-8■■■■■ 35
DDX3XO00571 SARAF-210ENST00000522055 582 ntTSL 321.71■■□□□ 1.079e-15■■■■■ 35
DDX3XO00571 SARAF-203ENST00000518174 1981 ntTSL 520.3■□□□□ 0.849e-15■■■■■ 35
DDX3XO00571 SARAF-202ENST00000517569 487 ntTSL 1 (best)20.05■□□□□ 0.89e-15■■■■■ 35
DDX3XO00571 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.759e-15■■■■■ 35
DDX3XO00571 SARAF-206ENST00000520303 1803 ntTSL 1 (best)19.32■□□□□ 0.689e-15■■■■■ 35
DDX3XO00571 SARAF-207ENST00000521083 419 ntTSL 219.17■□□□□ 0.669e-15■■■■■ 35
DDX3XO00571 SARAF-213ENST00000523761 566 ntTSL 418.93■□□□□ 0.629e-15■■■■■ 35
DDX3XO00571 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.469e-15■■■■■ 35
DDX3XO00571 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.381e-10■■■■■ 35
DDX3XO00571 LEPROTL1-206ENST00000520682 580 ntTSL 516.58■□□□□ 0.241e-10■■■■■ 35
DDX3XO00571 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.171e-10■■■■■ 35
DDX3XO00571 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.091e-10■■■■■ 35
DDX3XO00571 LEPROTL1-208ENST00000523116 1389 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.581e-10■■■■■ 35
DDX3XO00571 LEPROTL1-207ENST00000520739 559 ntTSL 44.34□□□□□ -1.711e-10■■■■■ 35
DDX3XO00571 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.763e-8■■■■■ 35
DDX3XO00571 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.473e-8■■■■■ 35
DDX3XO00571 TMEM177-206ENST00000496203 881 ntTSL 1 (best)16.67■□□□□ 0.263e-8■■■■■ 35
DDX3XO00571 TMEM177-205ENST00000445518 791 ntTSL 214.35□□□□□ -0.113e-8■■■■■ 35
DDX3XO00571 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.173e-8■■■■■ 35
DDX3XO00571 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.33e-8■■■■■ 35
DDX3XO00571 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.042e-11■■■■■ 35
DDX3XO00571 DNAJC1-201ENST00000376946 1013 ntTSL 315.01□□□□□ -0.012e-11■■■■■ 35
DDX3XO00571 SEMA4B-206ENST00000558895 533 ntTSL 425.32■■□□□ 1.643e-7■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 SEMA4B-218ENST00000561085 582 ntTSL 423.94■■□□□ 1.429e-9■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 SEMA4B-212ENST00000559792 585 ntTSL 421.4■■□□□ 1.023e-7■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 SEMA4B-215ENST00000560089 2804 ntTSL 1 (best)20.45■□□□□ 0.863e-7■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 SEMA4B-210ENST00000559300 541 ntTSL 418.84■□□□□ 0.619e-9■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 SEMA4B-211ENST00000559322 559 ntTSL 418.56■□□□□ 0.569e-9■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.413e-7■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.059e-9■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 PIGG-207ENST00000504187 1784 ntTSL 218.12■□□□□ 0.499e-15■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 PIGG-204ENST00000502311 1189 ntTSL 1 (best)17.46■□□□□ 0.399e-15■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 PIGG-211ENST00000506402 2387 ntTSL 1 (best)16.59■□□□□ 0.259e-15■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.149e-15■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.039e-15■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.089e-15■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.19e-15■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 PIGG-201ENST00000310340 3203 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.229e-15■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.249e-15■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 PIGG-220ENST00000511448 903 ntTSL 512.32□□□□□ -0.449e-15■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 PIGG-225ENST00000514953 583 ntTSL 412.14□□□□□ -0.479e-15■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 WNT3-201ENST00000225512 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.668e-7■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.82e-31■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 PET100-207ENST00000623154 1815 nt24.08■■□□□ 1.455e-8■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.015e-8■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 KCTD9-205ENST00000519665 2128 ntTSL 519.96■□□□□ 0.795e-8■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 KCTD9-207ENST00000521458 541 ntTSL 219.63■□□□□ 0.735e-8■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 KCTD9-204ENST00000518997 679 ntTSL 319.11■□□□□ 0.655e-8■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 KCTD9-203ENST00000518067 849 ntTSL 518.69■□□□□ 0.585e-8■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 KCTD9-209ENST00000523140 840 ntTSL 317.63■□□□□ 0.415e-8■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.015e-8■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 PET100-206ENST00000601829 317 ntTSL 212.11□□□□□ -0.475e-8■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 PET100-205ENST00000601406 332 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.515e-8■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 PET100-201ENST00000456958 219 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.065e-8■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 PET100-203ENST00000598540 375 ntTSL 35.68□□□□□ -1.55e-8■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 TP53I13-207ENST00000580132 446 ntTSL 317.71■□□□□ 0.439e-7■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 FAM57A-206ENST00000574327 852 ntTSL 329.27■■■□□ 2.285e-13■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.645e-13■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.525e-13■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.261e-6■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.821e-6■■■■■ 34.9
DDX3XO00571 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.114e-11■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.014e-11■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 UBE2F-212ENST00000439338 873 ntTSL 521.06■□□□□ 0.964e-11■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 UBE2F-206ENST00000416292 552 ntTSL 221.06■□□□□ 0.964e-11■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 UBE2F-217ENST00000448502 561 ntTSL 420.29■□□□□ 0.844e-11■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.834e-11■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 UBE2F-209ENST00000433568 574 ntTSL 420.25■□□□□ 0.834e-11■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 UBE2F-207ENST00000417231 984 ntTSL 520.14■□□□□ 0.814e-11■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 UBE2F-215ENST00000441728 1242 ntTSL 219.73■□□□□ 0.754e-11■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 UBE2F-218ENST00000454786 1292 ntTSL 517.08■□□□□ 0.324e-11■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 UBE2F-214ENST00000440223 830 ntTSL 316.99■□□□□ 0.314e-11■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.144e-11■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 UBE2F-219ENST00000455999 760 ntTSL 514.63□□□□□ -0.074e-11■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 UBE2F-216ENST00000445676 831 ntTSL 314.42□□□□□ -0.14e-11■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 UBE2F-213ENST00000439780 571 ntTSL 510.91□□□□□ -0.664e-11■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 UBE2F-208ENST00000433241 803 ntTSL 210.39□□□□□ -0.754e-11■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.374e-11■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.034e-7■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 ATP5A1-205ENST00000586592 2214 ntTSL 225.54■■□□□ 1.684e-38■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.614e-38■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 ATP5A1-216ENST00000591267 460 ntTSL 522■■□□□ 1.114e-38■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 ATP5A1-213ENST00000590406 756 ntTSL 319.81■□□□□ 0.764e-38■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 ATP5A1-207ENST00000588390 556 ntTSL 1 (best)19.81■□□□□ 0.764e-38■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 ATP5A1-208ENST00000589252 662 ntTSL 519.81■□□□□ 0.764e-38■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 ATP5A1-217ENST00000591981 565 ntTSL 415.11■□□□□ 0.014e-38■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 ATP5A1-211ENST00000590156 1931 ntTSL 215.01□□□□□ -0.014e-38■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 ATP5A1-210ENST00000589869 910 ntTSL 314.66□□□□□ -0.064e-38■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.24e-38■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.244e-38■■■■■ 34.8
DDX3XO00571 ATP5A1-214ENST00000590448 604 ntTSL 212.77□□□□□ -0.374e-38■■■■■ 34.8
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