Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ELL2O00472 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ELL2O00472 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ELL2O00472 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ELL2O00472 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ELL2O00472 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ELL2O00472 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ELL2O00472 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ELL2O00472 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ELL2O00472 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ELL2O00472 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ELL2O00472 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ELL2O00472 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ELL2O00472 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ELL2O00472 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ELL2O00472 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ELL2O00472 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ELL2O00472 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ELL2O00472 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ELL2O00472 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ELL2O00472 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ELL2O00472 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ELL2O00472 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ELL2O00472 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ELL2O00472 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ELL2O00472 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ELL2O00472 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ELL2O00472 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ELL2O00472 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ELL2O00472 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ELL2O00472 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ELL2O00472 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ELL2O00472 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ELL2O00472 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ELL2O00472 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ELL2O00472 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ELL2O00472 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ELL2O00472 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ELL2O00472 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ELL2O00472 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ELL2O00472 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ELL2O00472 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ELL2O00472 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ELL2O00472 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ELL2O00472 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ELL2O00472 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ELL2O00472 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ELL2O00472 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ELL2O00472 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ELL2O00472 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ELL2O00472 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ELL2O00472 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ELL2O00472 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ELL2O00472 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ELL2O00472 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ELL2O00472 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ELL2O00472 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ELL2O00472 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ELL2O00472 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ELL2O00472 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ELL2O00472 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ELL2O00472 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ELL2O00472 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ELL2O00472 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ELL2O00472 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ELL2O00472 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ELL2O00472 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ELL2O00472 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ELL2O00472 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ELL2O00472 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ELL2O00472 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ELL2O00472 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ELL2O00472 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ELL2O00472 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ELL2O00472 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ELL2O00472 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ELL2O00472 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ELL2O00472 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ELL2O00472 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ELL2O00472 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ELL2O00472 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ELL2O00472 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ELL2O00472 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ELL2O00472 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ELL2O00472 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ELL2O00472 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ELL2O00472 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ELL2O00472 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ELL2O00472 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ELL2O00472 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ELL2O00472 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ELL2O00472 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ELL2O00472 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ELL2O00472 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ELL2O00472 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ELL2O00472 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ELL2O00472 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ELL2O00472 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ELL2O00472 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ELL2O00472 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms