Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3KR12 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3KR12 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3KR12 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
J3KR12 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
J3KR12 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
J3KR12 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
J3KR12 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
J3KR12 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
J3KR12 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
J3KR12 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
J3KR12 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
J3KR12 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
J3KR12 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
J3KR12 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
J3KR12 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
J3KR12 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
J3KR12 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
J3KR12 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
J3KR12 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
J3KR12 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
J3KR12 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
J3KR12 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
J3KR12 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
J3KR12 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
J3KR12 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
J3KR12 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
J3KR12 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
J3KR12 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
J3KR12 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
J3KR12 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
J3KR12 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
J3KR12 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
J3KR12 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
J3KR12 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
J3KR12 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
J3KR12 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
J3KR12 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
J3KR12 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
J3KR12 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
J3KR12 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
J3KR12 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.94
J3KR12 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
J3KR12 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
J3KR12 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
J3KR12 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
J3KR12 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
J3KR12 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
J3KR12 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
J3KR12 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
J3KR12 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
J3KR12 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
J3KR12 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
J3KR12 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
J3KR12 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
J3KR12 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
J3KR12 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
J3KR12 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
J3KR12 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
J3KR12 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms